<div dir="rtl"><div style="text-align:left" dir="ltr">Hi!<br>I gave my protein to ClusPro for docking and it gave me the PDB file. For the next step, I need to upload to Prodigy, which requires me to separate the ligand chain and receptor chain to perform the analysis. But in the PDB file that I open in Chimera, there is only one chain, and ligand and receptor are divided as sub-branches of that chain, and Prodigy algorithm does not accept it.<br>I wanted to know how to divide the protein and its receptor into two different chains?</div><div style="text-align:left" dir="ltr"><br></div><div style="text-align:left" dir="ltr">Best regards!<br></div></div>