<div dir="ltr"><div>Hi all</div><div>Is it any command to measure the average distance between two non bonded atoms all over a molecular dynamics trajectory? Ideally linked to examining the trajectory with Tools ... MD/Ensemble Analysis ... MDmovie (I am using psf/dcd)</div><div>I.e., doing the average of the distance from all frames.<br></div><div><br></div><div>Thanks</div><div>francesco pietra<br></div></div>