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<div class="WordSection1">
<p class="MsoNormal">Thank you,<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p>
<p class="MsoNormal">Weimin<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p>
<div>
<div style="border:none;border-top:solid #E1E1E1 1.0pt;padding:3.0pt 0in 0in 0in">
<p class="MsoNormal"><b>From:</b> Elaine Meng <meng@cgl.ucsf.edu> <br>
<b>Sent:</b> Tuesday, September 27, 2022 12:06 PM<br>
<b>To:</b> Wu, Weimin /US <Weimin.Wu@sanofi.com><br>
<b>Cc:</b> chimera-users@cgl.ucsf.edu<br>
<b>Subject:</b> Re: [Chimera-users] save map<o:p></o:p></p>
</div>
</div>
<p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p>
<p class="MsoNormal">Dear Weimin,<br>
The map files do not contain orientation information, so you can't simply save the map after rotating it. Instead you would need to make a new map by resampling the moved map onto the grid of the reference map with "vop resample" -- this is explained in the
 bottom section of this page, "Saving Maps After Fitting":<br>
<<a href="https://www.rbvi.ucsf.edu/chimera/docs/UsersGuide/savemodel.html#afterfitting">https://www.rbvi.ucsf.edu/chimera/docs/UsersGuide/savemodel.html#afterfitting</a>><br>
<br>
I hope this helps,<br>
Elaine<br>
-----<br>
Elaine C. Meng, Ph.D. <br>
UCSF Chimera(X) team<br>
Department of Pharmaceutical Chemistry<br>
University of California, San Francisco<br>
<br>
> On Sep 27, 2022, at 7:47 AM, Wu, Weimin /US via Chimera-users <<a href="mailto:chimera-users@cgl.ucsf.edu">chimera-users@cgl.ucsf.edu</a>> wrote:<br>
> <br>
> Hi,<br>
> Does Chimera have a built-in function to save the map after it is fit into another map? The current save map could not save the new orientation and new location.
<br>
> Thanks,<br>
> Weimin<o:p></o:p></p>
</div>
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