<html>
  <head>
    <meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=UTF-8">
  </head>
  <body>
    <font face="Times New Roman, Times, serif">Thanks a lot, Elaine,
      this worked indeed!<br>
      Just one final point: how can I make the linewidth larger? When I
      make a picture, the thin lines of the box disappear.<br>
      I understand ChimeraX interpretes these lines as a surface, I can
      change the colour when choosing surface in the colour blow up.<br>
    </font><br>
    <div class="moz-cite-prefix">On 18/11/22 17:49, Elaine Meng wrote:<br>
    </div>
    <blockquote type="cite"
      cite="mid:23E0EB5C-3E08-40A4-9DE9-9ADCE0BDFABD@cgl.ucsf.edu">
      <meta http-equiv="content-type" content="text/html; charset=UTF-8">
      Hi Xavier,
      <div class="">
        <div class="">As far as I can tell, it is exactly the same in
          ChimeraX as in Chimera.  First, make sure you aren't using a
          very old version of ChimeraX.  I tried it in ChimeraX 1.5
          release candidate (2022-11-08)  just now:</div>
        <div class=""><br class="">
        </div>
        <div class="">- open your structure that has unit cell
          information, e.g. 1fav</div>
        <div class=""><br class="">
        </div>
        <div class="">- in Unit Cell tool (menu: Tools... Higher-Order
          Structure... Unit Cell) click Outline to show unit cell box</div>
        <div class=""><br class="">
        </div>
        <div class="">- if you want to change box outline color, can use
          the same method as described below for Chimera. I wasn't able
          to select it by Ctrl-click, however, so instead use the
          selection (hand with green dot) checkbox in the Model Panel to
          select it, then use Actions... Color... [...].    Or, you can
          just click the color square in the Model Panel and use the
          system color chooser to change the color interactively.  
          Screenshot:</div>
        <div class=""><br class="">
        </div>
        <div class=""><img apple-inline="yes"
            id="8B2B875F-1B7D-4B6A-8CAB-3054FA9558DF"
            src="cid:part1.u51Yw5Ft.OeAi1vaG@ibmb.csic.es" class=""
            width="465" height="542"></div>
        <div class=""><br class="">
        </div>
        <div class=""><br class="">
        </div>
        <div class="">I hope this helps,</div>
        <div class="">Elaine</div>
        <div class="">
          <div class="">-----<br class="">
            Elaine C. Meng, Ph.D.                       <br class="">
            UCSF Chimera(X) team<br class="">
            Department of Pharmaceutical Chemistry<br class="">
            University of California, San Francisco<br class="">
            <br class="">
            P.S. for ChimeraX questions specifically, you may want to
            use the other mailing list, <a
              href="mailto:chimerax-users@cgl.ucsf.edu"
              class="moz-txt-link-freetext" moz-do-not-send="true">chimerax-users@cgl.ucsf.edu</a> </div>
          <div class=""><br class="webkit-block-placeholder">
          </div>
          <blockquote type="cite" class="">On Nov 18, 2022, at 7:03 AM,
            F.Xavier Gomis-Rüth via Chimera-users <<a
              href="mailto:chimera-users@cgl.ucsf.edu"
              class="moz-txt-link-freetext" moz-do-not-send="true">chimera-users@cgl.ucsf.edu</a>>
            wrote:<br class="">
            <br class="">
            Dear Elaine,<br class="">
            I am now trying to get this done in ChimeraX where there is
            indeed a similar option. Unfortunately, if I proceed as in
            the instructions<br class="">
            I do not get the cell box, in contrast with old Chimera. I
            also tried through the command line but unsuccessfully.<br
              class="">
            Am I missing something?<br class="">
            Thanks a lot in advance,<br class="">
            Xavier<br class="">
            <br class="">
            On 26/10/22 17:45, Elaine Meng wrote:<br class="">
            <blockquote type="cite"
              cite="mid:DF1108B4-4150-47D7-AB1D-3386A328A049@cgl.ucsf.edu"
              class="">
              <div class="">Hi Xavier,</div>
              <div class="">You can select the box (Ctrl-click on it)
                and then use menu: Actions... Color... [choose color],
                then clear selection by Ctrl-click on blank area of
                window or menu Select... Clear Selection.</div>
              <div class="">I hope this helps,</div>
              <div class="">Elaine</div>
              <div class="">-----</div>
              <div class="">Elaine C. Meng, Ph.D.                       </div>
              <div class="">UCSF Chimera(X) team</div>
              <div class="">Department of Pharmaceutical Chemistry</div>
              <div class="">University of California, San Francisco</div>
              <div class=""><br class="">
              </div>
              <br class="Apple-interchange-newline">
              <blockquote type="cite" class="">On Oct 26, 2022, at 1:56
                AM, F.Xavier Gomis-Rüth via Chimera-users <<a
                  href="mailto:chimera-users@cgl.ucsf.edu"
                  class="moz-txt-link-freetext" moz-do-not-send="true">chimera-users@cgl.ucsf.edu</a>>
                <div class=""> wrote:</div>
                <div class=""><br class="">
                </div>
                <div class="">Dear all,</div>
                <div class="">is there a way in Chimera or ChimeraX to
                  get the unit-cell box being drawn in another colour
                  than white?</div>
                <div class="">This forces the background to be dark....</div>
                <div class="">Thanks a lot in advance,</div>
                <div class="">Xavier</div>
                <br class="Apple-interchange-newline">
              </blockquote>
            </blockquote>
            <br class="">
          </blockquote>
          <br class="">
        </div>
      </div>
    </blockquote>
    <br>
    <div class="moz-signature">-- <br>
      <img src="cid:part2.s5L7dLj2.9oNgVn9w@ibmb.csic.es" border="0"></div>
  </body>
</html>