<div dir="ltr"><div>Dear Developers,</div><div><br></div><div>I did phosphorylation of amino acid in protein, then I was about to  do energy minimization using Chimera MINIMIZE STRUCTURE module, but it is throwing the error ( I mentioned below ).</div><div><br></div><div>****************************************************<br>Running PARMCHK for PP.pdb<br>Using main parameter file parm10.dat modified by heme-iron.frcmod, frcmod.ff14SB, frcmod.ionsjc_tip3p<br><font size="4"><b>Chimera/MMTK cannot minimize structure, probably because there is no parameter for ''No parameters for bond Atom 0.TPO_144__0_0_1_145.N (atom type n) - Atom 0.GLN_143__0_0_1_144.peptide.C (atom type C)''</b></font></div><div><font size="4"><b>********************************************</b></font></div><div><br></div><div><font size="4"><b>Please help me to sort out the issue.</b></font></div><div><br></div><div><font size="4">I also tried to do phosphorylate using Chimera, even that structure also getting the same error while doing energy minimization.</font><br></div><div>-- <br><div dir="ltr" class="gmail_signature" data-smartmail="gmail_signature"><div dir="ltr"><div><span style="color:rgb(0,0,255)"><span style="background-color:rgb(255,255,255)"><b>Have a nice day,</b></span></span></div><div dir="ltr">Thanks & Regards,<div><font color="#ff0000"><b><font size="4">SELVA BABU S</font></b></font></div>M.Sc Scholar (Bioinformatics)</div><div dir="ltr"><div><b>TNAU, Coimbatore<br></b></div></div></div></div></div></div>