<div dir="ltr">Hello,<div><br></div><div>I am trying to place a <a href="https://www.cgl.ucsf.edu/chimerax/docs/user/commands/define.html#centroid">centroid</a> marker at the center of a selection of atoms, for example in the middle of a benzene ring that is at some arbitrary position in my system. I want to do some distance measurements here. I can do something like this:</div><div><br></div><div>shape sphere color orange radius 0.25 center sel</div><div><br></div><div>where the center sel places the sphere where I want, but these spheres can't be used to make measurements. Instead I think I need a marker object, such as:</div><div><br></div><div>define centroid radius 0.25 color orange <br><div><br></div><div>But I don't know how to recreate that `center sel` position. I have tried </div><div><br></div><div>define centroid radius 0.25 color orange position center</div><div> <br></div><div>define centroid radius 0.25 color orange position center sel</div><div><br></div><div>define centroid radius 0.25 color orange position sel<br></div><div><br></div><div>These do not work. I am under the impression that the centroid is a marker object and should have some position argument. Can anyone help me?</div><div><br></div><div>Thanks,</div><div><br></div>-- <br><div dir="ltr" class="gmail_signature" data-smartmail="gmail_signature"><div dir="ltr"><div dir="ltr"><div dir="ltr"><div dir="ltr"><div dir="ltr">German Barcenas</div><div dir="ltr">Ph.D Candidate | Materials Science and Engineering </div><div dir="ltr">Materials Modeling and Theory Group</div><div dir="ltr">Boise State University<br><div><a href="mailto:germanbarcenas@u.boisestate.edu" target="_blank">germanbarcenas@u.boisestate.edu</a> | 940-577-5094</div></div></div></div></div></div></div></div></div>