<html><head><meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=utf-8"></head><body style="word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; line-break: after-white-space;" class=""><div class="">To run AlphaFold for more than one sequence you need the ChimeraX daily build (aka 1.4).  The error you got suggests you are using ChimeraX 1.3 which only handles a single sequence.</div><div class=""><br class=""></div>The Internal Server Error can be ignored -- it may be the UCSF servers are down, it is just trying to check what plugins are available.<br class=""><div><br class=""></div><div><span class="Apple-tab-span" style="white-space:pre">        </span>Tom</div><div><br class=""><blockquote type="cite" class=""><div class="">On Mar 23, 2022, at 6:29 PM, Gawargi, Flobater I via ChimeraX-users <<a href="mailto:chimerax-users@cgl.ucsf.edu" class="">chimerax-users@cgl.ucsf.edu</a>> wrote:</div><br class="Apple-interchange-newline"><div class="">

<meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=utf-8" class="">

<div style="word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; line-break: after-white-space;" class="">
<div class="">Hi, </div>
<div class="">I am a new Chimerax user and I have encountered a problem that I hope you can help me fix. I installed 1.4 version and it shows "Startup Messages notes available bundle cache has not been initialized yet Updating list of available bundles failed:
 Internal Server Error” all I am trying to do is use alpha fold to predict structure of 2 proteins separated by comma. And it shows this error "Missing or invalid "sequences" argument: Sequences argument "cvfpfvflgkqyssctsdgrrdgrlwcattsnfdtdkkwgfcpdqgyslflvaahefghalgldhssvpealmyplysylegfplnkddidgiqylygrgskpdprppattttepqptapptmcptipptayptvgptvgptgapspgptsspspgptgapspgptapptagsseasteslspadnpcnvdvfdaiaeiqgalhffkdgwywkflnhrgsplqgpfltartw"
 is not a chain specifier, alignment id, UniProt id, or sequence characters” </div>
<div class="">I am using an M1 MacBook, but I have also tried it on windows running windows 10 and got the same issue. I would appreciate your input to fix this issue. </div>
<div class=""><br class="">
</div>
<div class="">Thank you, </div>
<div class="">Flobater Gawargi </div>
<div style="margin: 0px;" class=""><br class="">
<!--EndFragment--></div>
<div class=""><br class="">
</div>
<div class="">
<div style="font-family: Helvetica; font-size: 12px; font-style: normal; font-variant-caps: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px; text-decoration: none; caret-color: rgb(0, 0, 0);" class="">
<br class="">
</div>
<br class="Apple-interchange-newline" style="font-family: Helvetica; font-size: 12px; font-style: normal; font-variant-caps: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px; text-decoration: none; caret-color: rgb(0, 0, 0);">
<br class="Apple-interchange-newline" style="caret-color: rgb(0, 0, 0); font-family: Helvetica; font-size: 12px; font-style: normal; font-variant-caps: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px; text-decoration: none;">
</div>
<br class="">
<br class="">
The information in this e-mail may be privileged and confidential, intended only for the use of the addressee(s) above. Any unauthorized use or disclosure of this information is prohibited. If you have received this e-mail by mistake, please delete it and immediately
 contact the sender.
</div>

_______________________________________________<br class="">ChimeraX-users mailing list<br class=""><a href="mailto:ChimeraX-users@cgl.ucsf.edu" class="">ChimeraX-users@cgl.ucsf.edu</a><br class="">Manage subscription:<br class="">https://www.rbvi.ucsf.edu/mailman/listinfo/chimerax-users<br class=""></div></blockquote></div><br class=""></body></html>