<div dir="ltr"><div>Hi again,</div><div><br></div><div>Pardon for resurrecting another old thread: <a href="https://www.rbvi.ucsf.edu/pipermail/chimerax-users/2020-May/001139.html">https://www.rbvi.ucsf.edu/pipermail/chimerax-users/2020-May/001139.html</a></div><div><br></div><div>I have needed to extract selected blobs as separate surfaces (and also separate volumes) recently and found a way to do it within ChimeraX version 1.3 (2021-12-08), here's how:</div><div><br></div>1. Right mouse → Blob → right click desired blob to color it (any color different from the rest of the volume)<br><br>2. Split the surface based on colors:<br>sop splitbycolor #1.2<br><br>3. Use the desired split surface to mask the original volume data:<br>vol mask #1 surf #2.2 fullMap true<br><br>4. Save as a new volume:<br><div>save my_segmented_piece.mrc #3</div><div><br></div><div>Hope this helps :-)</div><div><br></div><div>Best wishes,</div><div><div><div><div dir="ltr" class="gmail_signature" data-smartmail="gmail_signature"><br>--<br>Ricardo Diogo Righetto<br></div></div></div></div></div>