<div dir="ltr">Thank you so much.  I will keep you posted about my progress. <div>Alicia gardiol</div></div><br><div class="gmail_quote"><div dir="ltr" class="gmail_attr">On Mon, Aug 1, 2022 at 12:45 PM Elaine Meng <<a href="mailto:meng@cgl.ucsf.edu">meng@cgl.ucsf.edu</a>> wrote:<br></div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left:1px solid rgb(204,204,204);padding-left:1ex">Hello Alicia,<br>
You can try using the Matchmaker tool.  ChimeraX menu: Tools... Structure Analysis... Matchmaker.  To see the help page, you can click the Help button on the tool, or you view the copy at our website:<br>
<br>
<<a href="https://rbvi.ucsf.edu/chimerax/docs/user/tools/matchmaker.html" rel="noreferrer" target="_blank">https://rbvi.ucsf.edu/chimerax/docs/user/tools/matchmaker.html</a>><br>
<br>
I hope this helps,<br>
Elaine<br>
-----<br>
Elaine C. Meng, Ph.D.                       <br>
UCSF Chimera(X) team<br>
Department of Pharmaceutical Chemistry<br>
University of California, San Francisco<br>
<br>
> On Jul 31, 2022, at 12:48 PM, Alicia Gardiol via ChimeraX-users <<a href="mailto:chimerax-users@cgl.ucsf.edu" target="_blank">chimerax-users@cgl.ucsf.edu</a>> wrote:<br>
> <br>
> We have experimental protein structures in PDB, and Alpha Fold predicted structures.  Which is the best software to superpose these structures using a MAC computer. <br>
> <br>
> - Two different predicted proteins (predicted 1 to predicted 2) and <br>
> - Same protein predicted and experimental (predicted 1 to experimental 1)<br>
> <br>
> Thank you and best wishes.<br>
> <br>
> Alicia Gardiol, PhD<br>
<br>
</blockquote></div>