<div dir="ltr">Thank you for the example! <br><div>Mary </div></div><br><div class="gmail_quote"><div dir="ltr" class="gmail_attr">On Mon, Sep 26, 2022 at 10:28 AM Tom Goddard <<a href="mailto:goddard@sonic.net">goddard@sonic.net</a>> wrote:<br></div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left:1px solid rgb(204,204,204);padding-left:1ex"><div style="overflow-wrap: break-word;"><div>Hi Mary,</div><div><br></div>The resfit command only works on amino acid sequences.  You can look at the density around specific residues using the Zone mouse mode in the "Right Mouse" toolbar.  You click on residues with right mouse button (or Command-click on Mac) and it shows just the residues and density nearby and labels the residues.  Here's an example<div><br></div><div><span style="white-space:pre-wrap">     </span>open 7tzt</div><div><span style="white-space:pre-wrap">        </span>open 7tzt from eds</div><div><span style="white-space:pre-wrap">       </span>ui mousemode right zone</div><div>        # Command-click on and atom of residue 89</div><div><br></div><div>Clicking on an atom and dragging up or down makes the zone shown around that residue larger or smaller.</div><div><br></div><div><span style="white-space:pre-wrap">      </span>Tom</div><div><br></div><div><img id="m_-55407749197884722068895E42C-5DE3-4E5C-B4FE-0DD817A5B387" width="577" height="477" src="cid:18385a3faf7205bfad21"></div><div><br><div><blockquote type="cite"><div>On Sep 22, 2022, at 7:54 PM, Mary Liu via ChimeraX-users <<a href="mailto:chimerax-users@cgl.ucsf.edu" target="_blank">chimerax-users@cgl.ucsf.edu</a>> wrote:</div><br><div><div dir="ltr">Dear Chimera X users, <div><br><div>Is it possible to show the fit of each nucleotide (not amino acid residue) in density using the resfit command or something like that?</div></div><div><br></div><div>Thanks</div></div>
_______________________________________________<br>ChimeraX-users mailing list<br><a href="mailto:ChimeraX-users@cgl.ucsf.edu" target="_blank">ChimeraX-users@cgl.ucsf.edu</a><br>Manage subscription:<br><a href="https://www.rbvi.ucsf.edu/mailman/listinfo/chimerax-users" target="_blank">https://www.rbvi.ucsf.edu/mailman/listinfo/chimerax-users</a><br></div></blockquote></div><br></div></div></blockquote></div>