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<div class="WordSection1">
<p class="MsoNormal">I want to use Isolde. I have chimera 1.14. Isolde is already a tool but I ran into an error when I ran clipper clipper assoc #1 to #2. Thanks that worked! I now have clipper.<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">-Dominique<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p>
<div style="border:none;border-top:solid #B5C4DF 1.0pt;padding:3.0pt 0in 0in 0in">
<p class="MsoNormal"><b><span style="font-size:12.0pt;color:black">From: </span></b><span style="font-size:12.0pt;color:black">Tristan Croll <tcroll@altoslabs.com><br>
<b>Date: </b>Monday, October 17, 2022 at 1:52 PM<br>
<b>To: </b>"Gutierrez, Dominique" <dgutierrez@gc.cuny.edu><br>
<b>Cc: </b>"chimerax-users@cgl.ucsf.edu" <chimerax-users@cgl.ucsf.edu><br>
<b>Subject: </b>[EXTERNAL] Re: [chimerax-users] chimeraX clipper install<o:p></o:p></span></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal">Firstly, are you sure you need to install Clipper separately? It’s mostly there as a support plugin for other bundles (particularly ISOLDE, also STRUDEL Score) and will be automatically installed when you install one of those. But to answer
 your main question, you need to do “toolshed install /path/to/wheelfile.whl” on the ChimeraX command line.<o:p></o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal">— Tristan <o:p></o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p>
<div>
<div>
<p class="MsoNormal">On Mon, 17 Oct 2022 at 18:42, Gutierrez, Dominique via ChimeraX-users <<a href="mailto:chimerax-users@cgl.ucsf.edu">chimerax-users@cgl.ucsf.edu</a>> wrote:<o:p></o:p></p>
</div>
<blockquote style="border:none;border-left:solid #CCCCCC 1.0pt;padding:0in 0in 0in 6.0pt;margin-left:4.8pt;margin-right:0in">
<div>
<div>
<p class="MsoNormal" style="mso-margin-top-alt:auto;mso-margin-bottom-alt:auto">Hello,<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal" style="mso-margin-top-alt:auto;mso-margin-bottom-alt:auto"> <o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal" style="mso-margin-top-alt:auto;mso-margin-bottom-alt:auto">I tried to install clipper with the popup window but it takes forever. I downloaded it directly from the website. Where do I put it .whl file?<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal" style="mso-margin-top-alt:auto;mso-margin-bottom-alt:auto"> <o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal" style="mso-margin-top-alt:auto;mso-margin-bottom-alt:auto">Best Regards,<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal" style="mso-margin-top-alt:auto;mso-margin-bottom-alt:auto">Dominique Gutierrez<o:p></o:p></p>
</div>
</div>
<p class="MsoNormal">_______________________________________________<br>
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<a href="mailto:ChimeraX-users@cgl.ucsf.edu" target="_blank">ChimeraX-users@cgl.ucsf.edu</a><br>
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