
<html>

<head>

<meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=iso-8859-1">

<style type="text/css" style="display:none;"> P {margin-top:0;margin-bottom:0;} </style>

</head>

<body dir="ltr">

<div class="elementToProof"><span style="font-family: Calibri, Arial, Helvetica, sans-serif; font-size: 12pt; color: rgb(0, 0, 0); background-color: rgb(255, 255, 255);" class="ContentPasted0">Hello! I am trying to measure the distance between two atoms in

 my trajectory in every 10<span><sup>th</sup> </span>frame. My approach was to use the perframe command paired with the distance command. Below was my attempt:</span></div>

<div class="elementToProof"><span style="font-family: Calibri, Arial, Helvetica, sans-serif; font-size: 12pt; color: rgb(0, 0, 0); background-color: rgb(255, 255, 255);" class="ContentPasted0"><br>

</span></div>

<div class="elementToProof"><span style="font-family: Calibri, Arial, Helvetica, sans-serif; font-size: 12pt; color: rgb(0, 0, 0); background-color: rgb(255, 255, 255);" class="ContentPasted0 ContentPasted1">perframe "distance /D:15@NH1 /B:42@OD1;distance save

 dist$1.txt;~distance /D:15@NH1 /B:42@OD1" interval 10<br>

</span></div>

<div class="elementToProof"><span style="font-family: Calibri, Arial, Helvetica, sans-serif; font-size: 12pt; color: rgb(0, 0, 0); background-color: rgb(255, 255, 255);" class="ContentPasted0 ContentPasted1"><br>

</span></div>

<div class="elementToProof" style="font-family: Calibri, Arial, Helvetica, sans-serif; font-size: 12pt; color: rgb(0, 0, 0); background-color: rgb(255, 255, 255);">

However, it instead simply outputs the distance of the currently displayed frame over and over again. Any help would be appreciated!</div>

<div class="elementToProof" style="font-family: Calibri, Arial, Helvetica, sans-serif; font-size: 12pt; color: rgb(0, 0, 0); background-color: rgb(255, 255, 255);">

<br>

</div>

<div class="elementToProof" style="font-family: Calibri, Arial, Helvetica, sans-serif; font-size: 12pt; color: rgb(0, 0, 0); background-color: rgb(255, 255, 255);">

Ben</div>

<div class="elementToProof" style="font-family: Calibri, Arial, Helvetica, sans-serif; font-size: 12pt; color: rgb(0, 0, 0); background-color: rgb(255, 255, 255);">

.........................................</div>

<div class="elementToProof" style="font-family: Calibri, Arial, Helvetica, sans-serif; font-size: 12pt; color: rgb(0, 0, 0); background-color: rgb(255, 255, 255);">

Benjamin Simonson</div>

<div class="elementToProof" style="font-family: Calibri, Arial, Helvetica, sans-serif; font-size: 12pt; color: rgb(0, 0, 0); background-color: rgb(255, 255, 255);">

MCIBS PhD Candidate</div>

<div class="elementToProof" style="font-family: Calibri, Arial, Helvetica, sans-serif; font-size: 12pt; color: rgb(0, 0, 0); background-color: rgb(255, 255, 255);">

Penn State University</div>

</body>

</html>