<div dir="ltr">Hey Eric,<br><div>actually I am using a backbone subset defined by Gromacs during the computing. Are you talking about backbone or main-chain sub-space?</div><div>I am using the latest version of ChimeraX but also I do have a ChimeraX daily installed on the same machine..</div><div>Cheers,</div><div>Enrico</div></div><br><div class="gmail_quote"><div dir="ltr" class="gmail_attr">Il giorno mar 17 gen 2023 alle ore 19:19 Eric Pettersen <<a href="mailto:pett@cgl.ucsf.edu">pett@cgl.ucsf.edu</a>> ha scritto:<br></div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left:1px solid rgb(204,204,204);padding-left:1ex">Hi Enrico,<br>
        Do you have all the backbone atoms, including the backbone oxygen?  What version of ChimeraX are you using?<br>
<br>
--Eric<br>
<br>
        Eric Pettersen<br>
        UCSF Computer Graphics Lab<br>
<br>
<br>
> On Jan 17, 2023, at 7:26 AM, Enrico Martinez via ChimeraX-users <<a href="mailto:chimerax-users@cgl.ucsf.edu" target="_blank">chimerax-users@cgl.ucsf.edu</a>> wrote:<br>
> <br>
> Dear Chimera-X users!<br>
> I am working on the visualization of a trajectory containing only back-bone atoms of the protein obtained from the PCA. When I load this multi-pdb ensemble to Chimera-X I can see only back-bone traces without any secondary structure information. I've tried to use dssp command to re-assign the secondary structure but it did not change the visualization state. Would it be possible to do it in some automatic fashion via some built-in command?<br>
> Many thanks in advance<br>
> Cheers<br>
> Enrico<br>
> _______________________________________________<br>
> ChimeraX-users mailing list<br>
> <a href="mailto:ChimeraX-users@cgl.ucsf.edu" target="_blank">ChimeraX-users@cgl.ucsf.edu</a><br>
> Manage subscription:<br>
> <a href="https://www.rbvi.ucsf.edu/mailman/listinfo/chimerax-users" rel="noreferrer" target="_blank">https://www.rbvi.ucsf.edu/mailman/listinfo/chimerax-users</a><br>
<br>
</blockquote></div>