[chimerax-users] error saving a surface
Tom Goddard
goddard at sonic.net
Wed Sep 8 11:24:12 PDT 2021
Hi Diego,
Saving an STL file should not give that error, and when I test it with --nogui --script it does not give this error. What does give that error is when you try to save an image when you have text labels in the graphics because it needs the graphical interface to get fonts.
If this does not explain your error use ChimeraX Help / Report a Bug and attach your python script.
Tom
Here was my test code
from chimerax.core.commands import run
run(session, 'open 1a0m')
run(session, 'molmap #1 5')
run(session, 'close #1')
run(session, 'save test.stl')
> On Sep 8, 2021, at 7:59 AM, Diego Amaya via ChimeraX-users <chimerax-users at cgl.ucsf.edu> wrote:
>
> Hi,
>
> I'm running a python script in --nogui and --script mode and I'm getting an error when doing rc(session, 'save surface.stl format stl'). The error message is :
>
> QGuiApplication::font(): no QGuiApplication instance and no application font set.
> Segmentation fault
>
> I'm working with debian 10 and I used the production release 1.2.5-1
>
> Thanks in advance for the help.
>
> --
> Diego A. Amaya Ramírez
>
> Aviso legal: El contenido de este mensaje y los archivos adjuntos son confidenciales y de uso exclusivo de la Universidad Nacional de Colombia. Se encuentran dirigidos sólo para el uso del destinatario al cual van enviados. La reproducción, lectura y/o copia se encuentran prohibidas a cualquier persona diferente a este y puede ser ilegal. Si usted lo ha recibido por error, infórmenos y elimínelo de su correo. Los Datos Personales serán tratados conforme a la Ley 1581 de 2012 y a nuestra Política de Datos Personales que podrá consultar en la página web www.unal.edu.co <http://www.unal.edu.co/>. Las opiniones, informaciones, conclusiones y cualquier otro tipo de dato contenido en este correo electrónico, no relacionados con la actividad de la Universidad Nacional de Colombia, se entenderá como personales y de ninguna manera son avaladas por la Universidad.
> _______________________________________________
> ChimeraX-users mailing list
> ChimeraX-users at cgl.ucsf.edu
> Manage subscription:
> https://www.rbvi.ucsf.edu/mailman/listinfo/chimerax-users
-------------- next part --------------
An HTML attachment was scrubbed...
URL: <http://plato.cgl.ucsf.edu/pipermail/chimerax-users/attachments/20210908/2bf12d3b/attachment.html>
More information about the ChimeraX-users
mailing list