[chimerax-users] distance between centers of mass using python API

Diego Amaya diaamayaram at unal.edu.co
Mon Sep 6 10:14:19 PDT 2021


Hello,

I'm trying to compute the distance between the centers of mass of two
residues using the python API. I tried two different ways :

1.


*rc(session, 'define centroid :43 massWeighting  true name AA1')rc(session,
'define centroid :35 massWeighting  true name AA2')rc(session, 'distance
AA1 AA2') *

2.


*rc(session, ' measure center :43 mark true name AA1')rc(session, 'measure
center :35 mark true name AA2')rc(session, 'distance AA1 AA2')*

But I get this error in the third line in both cases :

*chimerax.core.errors.UserError: Missing or invalid "objects" argument:
invalid objects specifier *

What is wrong ?

Thanks in advance.
-- 
Diego A. Amaya Ramírez

-- 
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