[chimerax-users] distance between centers of mass using python API
Diego Amaya
diaamayaram at unal.edu.co
Mon Sep 6 10:14:19 PDT 2021
Hello,
I'm trying to compute the distance between the centers of mass of two
residues using the python API. I tried two different ways :
1.
*rc(session, 'define centroid :43 massWeighting true name AA1')rc(session,
'define centroid :35 massWeighting true name AA2')rc(session, 'distance
AA1 AA2') *
2.
*rc(session, ' measure center :43 mark true name AA1')rc(session, 'measure
center :35 mark true name AA2')rc(session, 'distance AA1 AA2')*
But I get this error in the third line in both cases :
*chimerax.core.errors.UserError: Missing or invalid "objects" argument:
invalid objects specifier *
What is wrong ?
Thanks in advance.
--
Diego A. Amaya Ramírez
--
*Aviso legal:* El contenido de este mensaje y los archivos adjuntos son
confidenciales y de uso exclusivo de la Universidad Nacional de Colombia.
Se encuentran dirigidos sólo para el uso del destinatario al cual van
enviados. La reproducción, lectura y/o copia se encuentran prohibidas a
cualquier persona diferente a este y puede ser ilegal. Si usted lo ha
recibido por error, infórmenos y elimínelo de su correo. Los Datos
Personales serán tratados conforme a la Ley 1581 de 2012 y a nuestra
Política de Datos Personales que podrá consultar en la página web
www.unal.edu.co <http://www.unal.edu.co/>.* *Las opiniones, informaciones,
conclusiones y cualquier otro tipo de dato contenido en este correo
electrónico, no relacionados con la actividad de la Universidad Nacional de
Colombia, se entenderá como personales y de ninguna manera son avaladas por
la Universidad.
-------------- next part --------------
An HTML attachment was scrubbed...
URL: <http://plato.cgl.ucsf.edu/pipermail/chimerax-users/attachments/20210906/028a9ffb/attachment.html>
More information about the ChimeraX-users
mailing list